四川米仓山国家级自然保护区是由原鼓城山自然保护区更名而来的。1997年，为了保护旺苍县的自然生态环境，旺苍县人民政府决定把从未开发的鼓城山国营林场、旺苍县国营林场的国有林以及檬子乡、鼓城乡部分保存完好的集体林划为自然保护区。1999年2月，四川省人民政府批准鼓城山自然保护区为省级自然保护区。2002年8月，四川鼓城山自然保护区更名为四川米仓山自然保护区。2006年2月，经国务院办公厅[2006]9号文批准为国家级自然保护区。经过多年的建设，特别是经过保护区基础设施一期、二期工程和“5.12”地震灾后恢复重建等项目建设，米仓山国家级自然保护区现已成为集自然保护、科学研究、科普宣传教育、生态旅游等为一体的示范基地。2010年，加入“中国人与生物圈”自然保护区；2011年，区内的鼓城山——七里峡景区被评为国家4a级旅游景区；2012年，米仓山博物馆被四川省评为“省级科普基地”。 

主要职能是保护自然保护区内生物多样性和珍稀自然遗迹，维护生态平衡，进行保护区内自然环境和各种资源的保护、管理和开发工作。局内设机构为局办公室、保护科研股、生态旅游股、鼓城保护站、狮子坝保护站、檬子保护站。现有在职职工41人，其中在编23人，借用2人，聘用护林员、保安、保洁人员16人。

     保护区以亚热带与温带交汇地带的森林生态系统为主要保护对象。最高峰城墙岩海拔2281米，最低处宽滩河海拔仅570米，区内陡崖、峡谷、溶洞地貌十分发育。保护区具有丰富的生物多样性：分布有维管束植物195科949属2597种，其中属国家ⅰ级保护植物有红豆杉、南方红豆杉、银杏和独叶草4种；栖息有脊椎动物34目147科332属468种，其中属国家ⅰ级保护动物有扭角羚、林麝、豹、云豹、金雕5种。保护区不仅是水青冈属植物的起源中心，也是该属植物的现代分布中心，至今仍保存有7千余公顷水青冈原始林。全世界水青冈属植物约10种，其中亚洲7种，中国5种，而米仓山自然保护区内就有4种：米心水青冈、水青冈、亮叶水青冈和台湾水青冈。 米仓山自然保护区地理位置特殊，既是南北气候带的分界岭，又是东西植物区系的交汇处，特殊的地质、地貌特征和丰富多样的自然生态系统，具有较高的科普科考及观赏价值。区内有众多的奇山、秀水、异石、怪洞、长峡、飞瀑，亦有罕见的珍禽异兽，尤其是众多森林植物组成的生态系统更是魅力无穷，享有“仙境”之美誉。